一是外围突破法。检查“小金库”，仅从被查单位帐目上难以发现，一定要对有疑点的收支项目分类排队，采用抽样延伸的方法，追查到其下属单位、被管理单位、被收费罚款单位以及发生业务较多的单位。还可以采取发函查询的方法，使被查单位存在的收入不入帐，虚列支出，虚拨款项等问题原形毕露。此外，从被查单位还可以直接获取其上级主管部门、收费罚款单位、相关业务单位私设“小金库”的有关证据。所以“小金库”这个堡垒最易从外围攻破。
二是突击盘库法。在被查单位无准备情况下，用突击方式盘点其全部金库，并与现金日记帐，银行存款日记帐及总帐核对。发现库存现金与帐面余额不符，应当即查明原因。若库存现金数大于帐面余额，又不能说明正当来源，就是帐外“小金库”。若库存现金数小于帐面余额，查询去向不明，则可能为贪污或挪用。查询现金库盈亏的原因时，应分别询问出纳、财务主管、单位一把手等主要知情人。如他们各执一词，则更证明问题的存在。盘点现金库时，还要注意检查充抵库存现金的借条、现全支票、支票存根及发生时间编号、银行存款折、记事本等。发现疑点进一步追查收付款凭证、支票手续是否健全，内容是否合规合法，时间编号是否顺序相联。若在这些环节上也发现了帐外资金的证据，就更证实其会计记录不可靠，存在“小金库”。
三是帐面查疑法。查帐时要注意两种倾向的帐目。一种是记录混乱，帐证不符，帐实不符，加总帐有误，记录不完整，收支凭证内容不合法，手续不健全，甚至有涂改、挖补、伪造的凭证等。帐目混乱，就容易发生帐外“小金库”，乱中舞弊。可运用核对法，进行帐实核对，明细帐与总帐核对，证实问题的存在。
另一种是记载很规范的帐目，帐面上毫无违纪，甚至连一笔招待费都没有。有的是笔迹笔划一致的誊抄帐。这类帐可能是假帐，假帐背后就有帐外帐或“小金库”问题。检查方法同查混乱帐目相同，但重点是发现帐外收支项目，如帐外凭证、帐外物资等。
帐面查疑还要注意帐面上违反常规的奇异问题，包括奇异的数字金额，奇异的时间、地点，奇异的收支事项等，例如帐面上有司机工资支出而没有车辆购置费、维修费、油料费。没有生产经营项目的单位出现了生产经营费用、无建筑项目而发生建筑材料购置等，这些奇异的背后可能隐藏着贪污或“小金库”问题。
四是们行查询法。对被查单位的基本存款帐户，专用存款帐户，临时存款帐户等，要让其全部提供出来。结合银行存款帐、银行对帐单，进行查询核对。若发现银行存款帐与实际存款数额有差异时，应进一步追查原因。实际存款数大于帐面余额又不能说明正当理由。就可能是“小金库”。发现被查单位故意隐瞒存款帐户，就可能有帐外资金。此外，查询时，还应特别注意以单位财务人员、法定代表人的名义或以奇异的代名代号的存款，其收支频繁，数额较大，也可能是公款私存的“小金库”。
五是票据抽查法。单位的收支票据凭证应全部记帐，且存根联、发票联，有的还有出入库联必须保持一致，并按顺序编号。抽查票据时发现收入不入帐，各联数额下一致，大头小尾，缺页少号“走跳棋”等问题，就可能是隐瞒收入。“小金库”或虚报冒领等问题。运用票据抽查法，对有收罚款职能的单位更为有效。只要把其领用的票据收全，各联与帐面核对，必要时抽样延伸核查，便可发现收罚不入帐、不上缴、私设小金库截留坐支等问题。 .六是处置和出租资产追踪法。单位处置淘汰的办公用具、家具、设备、交通通讯工具及其他废料、残次品、包装物、副产品、低值易耗品，更新替换下的固定资产处理残值、出租闲置的固定资产等收入，这些收入往往易被忽视，或因疏于管理，流入个人腰包，或因单位故意作弊，收入不入帐，充填“小金库”。因此，对这类收入应作为检查的主要内容，从购进使用追踪到处置、出租，一追到底。发现收入不入帐，就说明存在“小金库”或贪污问题。
七是产量推算法。有的生产性企业以少报产量，做假帐目的手法，隐瞒收入，偷漏税收，设立“小金库”。对这类企业检查时，可根据其生产规模、生产能力、开工时间、原材料耗量、电力动力消耗量。管理费用消耗等项指标，比照同类企业和被查企业不同年度的生产情况，综合推算其产量。正常情况下，这些指标的配比应在一定的合理范围内。如被查企业帐面反映的产量与实际推算产量差异较大，指标配比异常，就说明该企业可能存在少报产量隐瞒收入，偷漏税收，私设“小金库”的问题，应进一步查证核实。
八是成本分析法。成本被称作是企业调整利润的“蓄水池”，隐瞒收入的“避风港”，为谋取本单位利益，截留国家收入，填充“小金库”资金，其手段之一就是多摊乱挤成本，进行成本分析，就是查企业是否严格按规定核算产品成本，正确计算收入。分析采购成本时，要注意其在原、辅材料采购中，有无舍近求远、舍优求劣、高价购劣、多支付运杂费、包装费等问题。分析生产成本，重点是查固定资产折旧的计提方法是否一致、计算是否正确、原辅材料费、燃料动力费、工资福利费、企业管理费支出是否合法合理，各期配比是否大体一致。如某项费用某一时期出奇的高，则应查明原因。分析销售成本，除检查销售费用开支外，还要查销售折扣、折让是否真实合法，销售退货是否验收入库，并进行帐务处理。必要时进行外调查询，如果发现虚假折扣、折让、退货不进仓、不入帐等问题，就可能将收入填充了“小金库”或有舞弊贪污问题。
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